Wang, R.; Zenobi, R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 378-385, 10.1016/j.jasms.2009.10.022
Iribarne, J. V.; Thomson, B. A. J. Chem. Phys. 1976, 64, 2287-2294, 10.1063/1.432536
Cole, R. B. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 763-772, 10.1002/1096-9888(200007)35:7<763::AID-JMS16>3.0.CO;2-#
Wang, G.; Cole, R. B. Anal. Chim. Acta 2000, 406, 53-65, 10.1016/S0003-2670(99)00599-1
Iavarone, A. T.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2319-2327, 10.1021/ja021202t
Li, J.; Santambrogio, C.; Brocca, S.; Rossetti, G.; Carloni, P.; Grandori, R. Mass Spectrom. Rev. 2016, 35, 111-122, 10.1002/mas.21465
Hogan, C. J.; Carroll, J. A.; Rohrs, H. W.; Biswas, P.; Gross, M. L. Anal. Chem. 2009, 81, 369-377, 10.1021/ac8016532
Breuker, K.; McLafferty, F. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 18145-18152, 10.1073/pnas.0807005105
Konermann, L.; Ahadi, E.; Rodriguez, A. D.; Vahidi, S. Anal. Chem. 2013, 85, 2-9, 10.1021/ac302789c
Zhao, F. F.; Matt, S. M.; Bu, J.; Rehrauer, O. G.; Ben-Amotz, D.; McLuckey, S. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2017, 28, 2001-2010, 10.1007/s13361-017-1732-x
Nshanian, M.; Lakshmanan, R.; Chen, H.; Ogorzalek Loo, R. R.; Loo, J. A. Int. J. Mass Spectrom. 2018, 427, 157-164, 10.1016/j.ijms.2017.12.006
Cech, N. B.; Enke, C. G. Mass Spectrom. Rev. 2001, 20, 362-387, 10.1002/mas.10008
Znamenskiy, V.; Marginean, I.; Vertes, A. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 7406-7412, 10.1021/jp034561z
Consta, S.; Mainer, K. R.; Novak, W. J. Chem. Phys. 2003, 119, 10125-10132, 10.1063/1.1619133
Loscertales, I. G.; Fernández de la Mora, J. J. Chem. Phys. 1995, 103, 5041-5060, 10.1063/1.470591
Kim, D.; Wagner, N.; Wooding, K.; Clemmer, D. E.; Russell, D. H. J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 2981-2988, 10.1021/jacs.6b10731
McAllister, R. G.; Metwally, H.; Sun, Y.; Konermann, L. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 12667-12676, 10.1021/jacs.5b07913
Porrini, M.; Rosu, F.; Rabin, C.; Darre, L.; Gomez, H.; Orozco, M.; Gabelica, V. ACS Cent. Sci. 2017, 3, 454-461, 10.1021/acscentsci.7b00084
Mehmood, S.; Allison, T. M.; Robinson, C. V. Annu. Rev. Phys. Chem. 2015, 66, 453-474, 10.1146/annurev-physchem-040214-121732
Leney, A. C.; Heck, A. J. R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2017, 28, 5-13, 10.1007/s13361-016-1545-3
Dyachenko, A.; Gruber, R.; Shimon, L.; Horovitz, A.; Sharon, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 7235-7239, 10.1073/pnas.1302395110
Gavriilidou, A. F. M.; Holding, F. P.; Mayer, D.; Coyle, J. E.; Veprintsev, D. B.; Zenobi, R. Biochemistry 2018, 57, 1685-1689, 10.1021/acs.biochem.7b01270
Shelimov, K. B.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2987-2994, 10.1021/ja962914k
Wyttenbach, T.; Pierson, N. A.; Clemmer, D. E.; Bowers, M. T. Annu. Rev. Phys. Chem. 2014, 65, 175-196, 10.1146/annurev-physchem-040513-103644
Ruotolo, B. T.; Hyung, S.-J.; Robinson, P. M.; Giles, K.; Bateman, R. H.; Robinson, C. V. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 8001-8004, 10.1002/anie.200702161
Jurneczko, E.; Barran, P. E. Analyst 2011, 136, 20-28, 10.1039/C0AN00373E
Silveira, J. A.; Servage, K. A.; Gamage, C. M.; Russell, D. H. J. Phys. Chem. A 2013, 117, 953-961, 10.1021/jp311278a
Warnke, S.; von Helden, G.; Pagel, K. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 1177-1180, 10.1021/ja308528d
Cammarata, M. B.; Thyer, R.; Rosenberg, J.; Ellington, A.; Brodbelt, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 9128-9135, 10.1021/jacs.5b04628
Quintyn, R. S.; Zhou, M.; Yan, J.; Wysocki, V. H. Anal. Chem. 2015, 87, 11879-11886, 10.1021/acs.analchem.5b03441
Felitsyn, N.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2001, 73, 4647-4661, 10.1021/ac0103975
Schwartz, B. L.; Bruce, J. E.; Anderson, G. A.; Hofstadler, S. A.; Rockwood, A. L.; Smith, R. D.; Chilkoti, A.; Stayton, P. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1995, 6, 459-465, 10.1016/1044-0305(95)00191-F
Jurchen, J. C.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2817-2826, 10.1021/ja0211508
Benesch, J. L. P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 341-348, 10.1016/j.jasms.2008.11.014
Boyd, R. K.; Somogyi, á. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 1275-1278, 10.1016/j.jasms.2010.04.017
Dongré, A. R.; Jones, J. L.; Somogyi, á.; Wysocki, V. H. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8365-8374, 10.1021/ja9542193
Jørgensen, T. J. D.; Gårdsvoll, H.; Ploug, M.; Roepstorff, P. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2785-2793, 10.1021/ja043789c
Li, J. Y.; Lyu, W. P.; Rossetti, G.; Konijnenberg, A.; Natalello, A.; Ippoliti, E.; Orozco, M.; Sobott, F.; Grandori, R.; Carloni, P. J. Phys. Chem. Lett. 2017, 8, 1105-1112, 10.1021/acs.jpclett.7b00127
Fegan, S. K.; Thachuk, M. J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 2531-2539, 10.1021/ct300906a
Popa, V.; Trecroce, D. A.; McAllister, R. G.; Konermann, L. J. Phys. Chem. B 2016, 120, 5114-5124, 10.1021/acs.jpcb.6b03035
Nesatyy, V. J.; Suter, M. J.-F. J. Mass Spectrom. 2004, 39, 93-97, 10.1002/jms.522
Fenn, J. B. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1993, 4, 524-535, 10.1016/1044-0305(93)85014-O
Katta, V.; Chait, B. T. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 8534-8535, 10.1021/ja00022a058
Dobo, A.; Kaltashov, I. A. Anal. Chem. 2001, 73, 4763-4773, 10.1021/ac010713f
Konermann, L.; Douglas, D. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 9, 1248-1254, 10.1016/S1044-0305(98)00103-2
Wang, G.; Abzalimov, R. R.; Kaltashov, I. A. Anal. Chem. 2011, 83, 2870-2876, 10.1021/ac200441a
Loo, J. A.; Edmonds, C. G.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1990, 62, 693-698, 10.1021/ac00206a009
Borysik, A. J. H.; Radford, S. E.; Ashcroft, A. E. J. Biol. Chem. 2004, 279, 27069-27077, 10.1074/jbc.M401472200
Marshall, A. G.; Hendrickson, C. L.; Jackson, G. S. Mass Spectrom. Rev. 1998, 17, 1-35, 10.1002/(SICI)1098-2787(1998)17:1<1::AID-MAS1>3.0.CO;2-K
Zubarev, A. R.; Makarov, A. Anal. Chem. 2013, 85, 5288-5296, 10.1021/ac4001223
Han, X.; Jin, M.; Breuker, K.; McLafferty, F. W. Science 2006, 314, 109-112, 10.1126/science.1128868
Compton, P. D.; Zamdborg, L.; Thomas, P. M.; Kelleher, N. L. Anal. Chem. 2011, 83, 6868-6874, 10.1021/ac2010795
Guevremont, R.; Siu, K. W. M.; Le Blanc, J. C. Y.; Berman, S. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1992, 3, 216-224, 10.1016/1044-0305(92)87005-J
Wang, G.; Cole, R. B. Org. Mass Spectrom. 1994, 29, 419-427, 10.1002/oms.1210290805
Kelly, M. A.; Vestling, M. M.; Fenselau, C. C.; Smith, P. B. Org. Mass Spectrom. 1992, 27, 1143-1147, 10.1002/oms.1210271028
Prakash, H.; Mazumdar, S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 1409-1421, 10.1016/j.jasms.2005.04.002
Creighton, T. E. Proteins; W. H. Freeman & Co.: New York, 1993.
Bonner, J. G.; Lyon, Y. A.; Nellessen, C.; Julian, R. R. J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 10286-10293, 10.1021/jacs.7b02428
Schnier, P. D.; Gross, D. S.; Williams, E. R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1995, 6, 1086-1097, 10.1016/1044-0305(95)00532-3
Jha, A. K.; Colubri, A.; Freed, K. F.; Sosnick, T. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 13099-13104, 10.1073/pnas.0506078102
Consta, S.; Malevanets, A. Phys. Rev. Lett. 2012, 109, 148301, 10.1103/PhysRevLett.109.148301
Donor, M. T.; Ewing, S. A.; Zenaidee, M. A.; Donald, W. A.; Prell, J. S. Anal. Chem. 2017, 89, 5107-5114, 10.1021/acs.analchem.7b00673
Beveridge, R.; Phillips, A. S.; Denbigh, L.; Saleem, H. M.; MacPhee, C. E.; Barran, P. E. Proteomics 2015, 15, 2872-2883, 10.1002/pmic.201400605
Yue, X.; Vahidi, S.; Konermann, L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2014, 25, 1322-1331, 10.1007/s13361-014-0905-0
Brini, E.; Fennell, C. J.; Fernandez-Serra, M.; Hribar-Lee, B.; Luksic, M.; Dill, K. A. Chem. Rev. 2017, 117, 12385-12414, 10.1021/acs.chemrev.7b00259
Iyengar, S. S.; Day, T. J. F.; Voth, G. A. Int. J. Mass Spectrom. 2005, 241, 197-204, 10.1016/j.ijms.2004.12.003
Marx, D.; Tuckerman, M. E.; Hutter, J.; Parrinello, M. Nature 1999, 397, 601-604, 10.1038/17579
Caleman, C.; van der Spoel, D. J. Chem. Phys. 2006, 125, 154508, 10.1063/1.2357591
Abraham, M. J.; Murtola, T.; Schulz, R.; Páll, S.; Smith, J. C.; Hess, B.; Lindahl, E. SoftwareX 2015, 1-2, 19-25, 10.1016/j.softx.2015.06.001
Sun, Y.; Vahidi, S.; Sowole, M. A.; Konermann, L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2016, 27, 31-40, 10.1007/s13361-015-1244-5
Huang, J.; MacKerell, A. D. J. Comput. Chem. 2013, 34, 2135-2145, 10.1002/jcc.23354
Piana, S.; Lindorff-Larsen, K.; Shaw, D. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 5915-5920, 10.1073/pnas.1218321110
Abascal, J. L. F.; Vega, C. J. Chem. Phys. 2005, 123, 234505, 10.1063/1.2121687
Vega, C.; de Miguel, E. J. Chem. Phys. 2007, 126, 154707, 10.1063/1.2715577
Konermann, L.; Metwally, H.; McAllister, R. G.; Popa, V. Methods 2018, 144, 104-112, 10.1016/j.ymeth.2018.04.010
Covey, T. R.; Thomson, B. A.; Schneider, B. B. Mass Spectrom. Rev. 2009, 28, 870-897, 10.1002/mas.20246
Hoover, W. G. Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1985, 31, 1695-1697, 10.1103/PhysRevA.31.1695
Bush, M. F.; Saykally, R. J.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 9122-9128, 10.1021/ja801894d
Fatunmbi, O.; Abzalimov, R. R.; Savinov, S. N.; Gershenson, A.; Kaltashov, I. A. Biochemistry 2016, 55, 1918-1928, 10.1021/acs.biochem.5b00807
Ewing, S. A.; Donor, M. T.; Wilson, J. W.; Prell, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2017, 28, 587-596, 10.1007/s13361-017-1594-2
Eliezer, D.; Yao, J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Nat. Struct. Biol. 1998, 18, 148-155, 10.1038/nsb0298-148
Zenaidee, M. A.; Leeming, M. G.; Zhang, F. T.; Funston, T. T.; Donald, W. A. Angew. Chem., Int. Ed. 2017, 56, 8522-8526, 10.1002/anie.201702781
Benesch, J. L. P.; Ruotolo, B. T.; Simmons, D. A.; Robinson, C. V. Chem. Rev. 2007, 107, 3544-3567, 10.1021/cr068289b
